Открытие обновленной экспозиции в 2012 года было приурочено к юбилею города Лесного. Экспозиционеры отказались от классического хронологического подхода и показали историю города через предметы, характерные для той или иной вехи его развития. Основу экспозиции составляют интерьеры кабинета первого директора завода Д. Васильева, городской квартиры, уголки увлечений мужчин и представительниц прекрасного пола 1950-60-х годов. Интерактивная карта рассказывает о поэтапной застройке города.

Значительное место отведено мультимедийным средствам сопровождения экспозиции: информационно-сенсорная панель, совмещенная с интерактивным киоском, проекционная система, создающая эффект ложной голографии с презентацией, рассказывающей о строении атома.

Залы музея превратившись в своеобразную машину времени, ждут новых путешественников сквозь время и пространство.